Lexus GS získal v bariérovom teste Euro NCAP najvyššie päťhviezdičkové hodnotenie a s 35 bodmi sa v uvedenej kategórii stal najbezpečnejším luxusným vozidlom pre dospelých cestujúcich. Vo výslednom hodnotení bočného nárazu získalo GS maximálny počet 18 bodov a čelný náraz bol ohodnotený 15 bodmi (zo 16 možných. Nový Lexus rovnako získal vysoké hodnotenie v triede pre ochranu chodcov (18 bodov a dve hviezdičky), v hodnotení ochrany detí mu patrí 41 bodov a 4 hviezdičky.
Za takýmito výsledkami stojí „niekoľkometrový“ zoznam bezpečnostných systémov – GS môže byť vybavené až 10 airbagmi: dvoma dvojfázovými vpredu (SRS-Supplemental Restraint System), bočnými airbagmi pre cestujúcich vpredu i vzadu, hlavovými airbagmi a dvoma kolennými airbagmi pre vodiča a spolujazdca. Ďalej tu máme poslednú generáciu elektronického systému Vehicle Dynamics Integrated Management (VDIM), ktorý zlepšuje jazdné parametre, optimalizuje trakciu a zvyšuje stabilitu automobilu. V príplatkovej výbave nájdeme aj systém Pre-Crash Safety (PCS), ktorý preventívne optimalizuje činnosť predných bezpečnostných pásov a brzdového asistenta s cieľom zabrániť vážnemu zraneniu cestujúcich a poškodeniu vozidla. Vo výbave nového Lexusu GS môže byť i adaptívny tempomat (Adaptive Cruise Control –ACC), ktorý samočinne reguluje a nastavuje rýchlosť podľa vpredu idúceho vozidla. Systém Intelligent Adaptive Front Lighting (I-AFS) zlepšuje viditeľnosť v zákrutách a zariadenie Tyre Pressure Warning System (TPWS) detekuje stratu tlaku v jednej či vo viacerých pneumatikách.